利用数据挖掘技术分析HIF-1α 在胃癌中的预后意义

doi:10. 3969 / j. issn. 2096-2266. 2018. 02. 008

大理大学学报

利用数据挖掘技术分析HIF-1α 在胃癌中的预后意义

（1. 大理大学基础医学院，云南大理671000；2. 大理大学第三附属医院病理科，云南大理671000；
3. 云南大学生命科学学院，昆明530061）

收稿日期:2017-07-01 出版日期:2018-02-15 发布日期:2018-02-15
作者简介:孙美涛，硕士研究生，主要从事肿瘤病理学研究.
基金资助:
国家自然科学基金资助项目（81560458；31601155）；云南省中青年学术技术带头人后备人才资助项目（2017HB077）；
大理大学大学生创新创业训练计划资助项目（X-CXCY-2016-13）

Analysis of the Prognostic Roles of HIF-1α in Gastric Carcinoma Using Data Mining Technology

（1. Pre-clinical College, Dali University, Dali, Yunnan 671000, China; 2. Department of Pathology, The Third Affiliated Hospital of
Dali University, Dali, Yunnan 671000, China; 3. College of Life Sciences, Yunnan University, Kunming 530061, China）

Received:2017-07-01 Online:2018-02-15 Published:2018-02-15

摘要/Abstract

摘要： 目的：基于数据挖掘分析缺氧诱导因子-1α（Hypoxia-inducible factor-1α，HIF-1α）基因在胃癌中的表达及预后意义。
方法：利用Oncomine数据库对HIF-1α基因在胃癌中的表达进行荟萃分析；利用cBioportal在线工具分析TCGA数据库中HIF-1α
在胃癌中的突变情况；利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析HIF-1α 表达对胃癌患者生存时间的影响。结果：Oncomine数据库
荟萃分析发现，共有12项研究涉及HIF-1α 在胃癌和正常组织中的表达，包括798例临床样本，与对照组相比，HIF-1α 在胃癌
中高表达，差异具有统计学意义（P=0.000 216）。Kaplan-Meier Plotter数据库分析发现，肠型、弥漫型及混合型胃癌患者中，与
HIF-1α 高表达组相比，HIF-1α 低表达组胃癌患者的累积存活时间均显著延长（HR＜1.0，P＜0.05）。结论：通过数据挖掘，提
示HIF-1α 基因在胃癌组织中高表达，且是胃癌患者预后的保护因素。

关键词: HIF-1α, 胃癌, 数据挖掘, 预后

Abstract: Objective: To analyze the prognostic roles of HIF-1α expression in gastric carcinoma based on data mining. Methods:
Using Oncomine database to analyze the expression of HIF-1α in gastric carcinoma. Using cBioportal online tool to analyze the gene
mutation of HIF-1α in gastric carcinoma. Using Kaplan-Meier Plotter database to analyze the prognostic roles of HIF-1α in gastric
carcinoma patients. Results: A total of 12 studies were involved HIF-1α in gastric carcinoma tissues and normal tissues, including 798
samples. Overall, using Kaplan Meier-Plotter database to analyze the prognostic roles of HIF- 1α in gastric carcinoma patients, the
results showed that high HIF-1α expression could improve the survival time of the patients with intestinal type gastric, with diffused
gastric carcinoma, or with mixed type gastric carcinoma, respectively（HR＜1.0, P＜0.05）. Conclusion: Through data mining, it is
suggested that HIF- 1α is highly expressed in gastric carcinoma tissue, and the prognosis of patients with gastric carcinoma was
strongly correlated with the HIF-1α expression. HIF-1α is the protective factor for the prognosis of gastric cancer.

Key words: HIF-1α, gastric cancer, data mining, prognosis

孙美涛，自加吉，陈莹，严长宝，戴莉萍，余敏，熊伟. 利用数据挖掘技术分析HIF-1α 在胃癌中的预后意义[J]. 大理大学学报, DOI: 10. 3969 / j. issn. 2096-2266. 2018. 02. 008.

Sun Meitao, Zi Jiaji, Chen Ying, Yan Changbao, Dai Liping, Yu Min, Xiong Wei. Analysis of the Prognostic Roles of HIF-1α in Gastric Carcinoma Using Data Mining Technology[J]. Journal of Dali University, DOI: 10. 3969 / j. issn. 2096-2266. 2018. 02. 008.

0
/ / 推荐

导出引用管理器 EndNote|Ris|BibTeX

链接本文: http://journal15.magtechjournal.com/Jwk_dlxyzk/CN/10. 3969 / j. issn. 2096-2266. 2018. 02. 008

http://journal15.magtechjournal.com/Jwk_dlxyzk/CN/Y2018/V3/I2/32

参考文献

〔1〕TORRE L A，BRAY F，SIEGEL R L，et al. Global cancer
statistics，2012〔J〕. CA Cancer J Clin，2015，65（2）：87-108.
〔2〕CREW K D，NEUGUT A I. Epidemiology of gastric can?
cer〔J〕. World J Gastroenterol，2006，12（3）：354-362.
〔3〕YANG L. Incidence and mortality of gastric cancer in Chi?
na〔J〕. World J Gastroenterol，2006，12（1）：17-20.
〔4〕韩毅力，程永毅，徐永刚. 低氧条件下HIF-1α对HGF表
达影响的观察〔J〕. 中华肿瘤防治杂志，2012，19（18）：
1377-1379.
〔5〕SEMENZA G L，WANG G L. A nuclear factor induced by
hypoxia via de novo protein synthesis binds to the human
erythropoietin gene enhancer at a site required for tran?
scriptional activation.〔J〕. Molecular and Cellular Biology，
1992，12（12）：5447-5454.
〔6〕LI L，ZHANG L，ZHANG X，et al. Hypoxia-inducible fac?
tor linked to differential kidney cancer risk seen with type
2A and type 2B VHL mutations〔J〕. Mol Cell Biol，2007，27
（15）：5381-5392.
〔7〕SEMENZA G L. Hypoxia-inducible factors in physiology
and medicine〔J〕. Cell，2012，148（3）：399-408.
〔8〕VAUPEL P，MAYER A. Hypoxia in cancer：significance
and impact on clinical outcome〔J〕. Cancer Metastasis Rev，
2007，26（2）：225-239.
〔9〕BROWN J M. The hypoxic cell：a target for selective cancer
therapy- eighteenth Bruce F. Cain Memorial Award lec?
ture〔J〕. Cancer Res，1999，59（23）：5863-5870.
〔10〕CHEN X，LEUNG S Y，YUEN S T，et al. Variation in gene
expression patterns in human gastric cancers〔J〕. Mol Biol
Cell，2003，14（8）：3208-3215.
〔11〕CHO J Y，LIM J Y，CHEONG J H，et al. Gene expression
signature- based prognostic risk score in gastric can?
cer〔J〕. Clin Cancer Res，2011，17（7）：1850-1857.
〔12〕CUI J，CHEN Y，CHOU W C，et al. An integrated tran?
scriptomic and computational analysis for biomarker iden?
tification in gastric cancer〔J〕. Nucleic Acids Research，
2011，39（4）：1197-1207.
〔13〕D'ERRICO M，DE RINALDIS E，BLASI M F，et al. Ge?
nome-wide expression profile of sporadic gastric cancers
with microsatellite instability〔J〕. Eur J Cancer，2009，45
（3）：461-469.
〔14〕WANG Q，WEN Y G，LI D P，et al. Upregulated INHBA
expression is associated with poor survival in gastric can?
cer〔J〕. Med Oncol，2012，29（1）：77-83.
〔15〕高燕，崔艳欣，姜相君. Dnmt1基因单核苷酸多态性与
胃癌的关系〔J〕. 中国癌症防治杂志，2015，7（6）：394-
397.
〔16〕CUNINGHAME S，JACKSON R，ZEHBE I. Hypoxia-in?
ducible factor 1 and its role in viral carcinogenesis〔J〕. Vi?
rology，2014（456/457）：370-383.
〔17〕窦鹏挥，胡春荣，马利峰，等. PTEN和缺氧诱导因子-
1α 在食管鳞癌组织中的表达〔J〕. 黑龙江医药科学，
2017，40（1）：67-68.
〔18〕SEMENZA G L. Targeting HIF-1 for cancer therapy〔J〕.
Nat Rev Cancer，2003，3（10）：721-732.
〔19〕王巍，张志常，宋晓雯，等. 基于数据挖掘分析PDCD5
表达对胃癌预后的影响〔J〕. 现代肿瘤医学，2016，24
（24）：3957-3959.
〔20〕黄震震. 基于整合的TCGA数据库探索基因组学与临
床数据关系〔D〕. 杭州：浙江大学，2016.
〔21〕SZÁSZ A M，LÁNCZKY A，NAGY Á，et al. Cross-valida?
tion of survival associated biomarkers in gastric cancer us?
ing transcriptomic data of 1，065 patients〔J〕. Oncotarget，
2016，7（31）：49322-49333.

[1]	施荣杰,陈序,寸向农 . 18例闭孔疝的临床诊治分析[J]. 大理大学学报, 2020, 5(2): 65-67.
[2]	黄丽华，罗娇，李权润，顾伟. 肾综合征出血热合并急性胰腺炎2例及文献复习[J]. 大理大学学报, 2020, 5(10): 48-50.
[3]	何杰, 张杉杉, 申伟, 李娜, 刘青铃, 王宁, 吴学东. 成功救治新生儿急性阴囊坏死性筋膜炎1例并文献复习[J]. , 2019, 4(8): 16-22.
[4]	赖敬业, 陈会永, 赵峰. 腹腔镜与开腹胃癌根治术临床疗效比较研究[J]. , 2019, 4(4): 52-55.
[5]	高斯媛, 杜映荣, 张芳容, 李晖. 肝衰竭患者血清存活素抗体的表达及意义[J]. , 2018, 3(8): 38-42.
[6]	谢思远，何晓明，王少博，刘仁贵. 急性肢体缺血外科治疗和预后的临床研究[J]. , 2017, 2(2): 58-60.
[7]	黎蒙，邵宇，舒武英，谭云波. 腹腔镜胃癌根治术与传统胃癌根治术的临床效果比较[J]. J4, 2016, 1(4): 42-45.
[8]	杨继武，程伟，赵鹏举. 腹腔镜辅助下胃癌根治术盲点及对策[J]. J4, 2016, 1(10): 43-45.
[9]	朱为梅，李莎莉. 肠道套细胞淋巴瘤6例临床分析并文献复习[J]. J4, 2015, 14(8): 22-24.
[10]	杨春芳. 腹腔镜下胃癌根治术36例围手术期护理[J]. J4, 2015, 14(8): 77-79.
[11]	. 灯盏乙素对胃癌细胞株的体外抑制作用[J]. J4, 2011, 10(6): 14-16.

利用数据挖掘技术分析HIF-1α 在胃癌中的预后意义

Analysis of the Prognostic Roles of HIF-1α in Gastric Carcinoma Using Data Mining Technology

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 11

编辑推荐

Metrics

本文评价